- g -

• GetAddressAsDelimitedString() : Address
• GetAddressAsJSON() : Address
• GetAddressAsString() : Address
• GetAddressFromJSON() : Address
• GetAllExistingMongoResultsAsJSON() : MongoTool
• GetAllExistingSQLiteResultsAsJSON() : SQLiteTool
• GetAllExternalServersFromServersManager() : ServersManager
• GetAllMongoResultsAsJSON() : MongoTool
• GetAllMongoResultsForKeyValuePair() : MongoTool
• GetAllServiceJobsFromJobsManager() : JobsManager
• GetAllSQLClausesAsString() : SQLClauseList
• GetAllSQLiteResultsAsJSON() : SQLiteTool
• GetAllSQLiteResultsForKeyValuePair() : SQLiteTool
• GetAllUsers() : GrassrootsServer
• GetAndAddBlastArgs() : ArgsProcessor
• GetAndAddDatabaseMappedParameter() : BlastServiceJob
• GetArgsAsString() : ByteBufferArgsProcessor
• GetArgsAsStrings() : StringsArgsProcessor
• GetArgsProcessor() : DrmaaBlastTool , ExternalBlastTool , SystemBlastTool
• GetAsJSON() : BlastTool
• GetAsyncTaskFromCountAsyncTask() : CountAsyncTask
• GetAvailableServicesRequestForAllProviders() : ProvidersStateTable
• GetBlastServiceConfig() : BlastServiceData
• GetBlastServiceJobFromJSON() : BlastServiceJob
• GetBlastStatus() : BlastTool
• GetBlastToolFactory() : BlastToolFactory
• GetByteBufferData() : ByteBuffer
• GetByteBufferSize() : ByteBuffer
• GetCachedServiceJobStatus() : ServiceJob
• GetConnectionData() : Connection
• GetConvertedOutput() : BlastFormatter , SystemBlastFormatter
• GetConvertedOutputFilename() : BlastFormatter
• GetCoordinateAsJSON() : Coordinate
• GetCurlToolData() : CurlTool
• GetCurlToolDataSize() : CurlTool
• GetCurrentServiceStatus() : Service
• GetCurrentStringParameterValueFromParameterSet() : ParameterSet
• GetCurrentValuesAsJSON() : MongoTool
• GetCurrentValuesFromSQLiteToolAsJSON() : SQLiteTool
• GetData() : TempFile
• GetDrmaaToolStatus() : DrmaaTool
• GetDrmmaaServiceJobAsJSON() : DrmaaServiceJob
• GetDrmmaaServiceJobFromJSON() : DrmaaServiceJob
• GetErrorsOutput() : OutputStream
• GetExternalServerAsJSON() : ExternalServer
• GetExternalServerFromServersManager() : ServersManager
• GetFactoryName() : BlastTool
• GetFilename() : TempFile
• GetFromHashTable() : HashTable
• GetFromJSON() : DrmaaBlastTool
• GetFullUsername() : User
• GetGlobalConfigValue() : GrassrootsServer
• GetGlobalServiceConfig() : GrassrootsServer
• GetGrassrootsServerFromService() : Service
• GetHandlerDescription() : Handler
• GetHandlerName() : Handler
• GetHandlerProtocol() : Handler
• GetHandlerStatus() : Handler
• GetHashTableSize() : HashTable
• GetInitialisedProvidersStateTable() : ProvidersStateTable
• GetInitialisedProvidersStateTableForSingleService() : ProvidersStateTable
• GetInitialisedResponseOnServer() : GrassrootsServer
• GetInputFile() : AsyncSystemPolymarkerTool
• GetInterestedServiceJSON() : Service
• GetJobFilename() : ExternalBlastTool
• GetJobsManager() : JobsManager
• GetKeysIndexFromHashTable() : HashTable
• GetKeyValuePairAsJSON() : KeyValuePair
• GetKeyValuePairFromJSON() : KeyValuePair
• GetLinkedListIterator() : Iterator
• GetLinkedServiceAsJSON() : LinkedService
• GetLog() : AsyncSystemPolymarkerTool , BlastTool , ExternalBlastTool , PolymarkerTool
• GetLogOutput() : OutputStream
• GetLuceneFacetAsJSON() : LuceneFacet
• GetLuceneFacetFromResultsJSON() : LuceneFacet
• GetName() : BlastTool , BlastToolFactory , DrmaaBlastToolFactory , PolymarkerTool , SystemBlastToolFactory
• GetNextItemFromIterator() : Iterator
• GetNextMatch() : RegExp
• GetNextServiceJobFromServiceJobSetIterator() : ServiceJobSetIterator
• GetNumberOfMatches() : RegExp
• GetNumberOfServiceJobResults() : ServiceJob
• GetOutputFolder() : AsyncSystemPolymarkerTool
• GetOutputFormat() : BlastTool
• GetOutputFormatAsString() : SystemBlastFormatter
• GetParameterAsJSON() : Parameter
• GetParameterDescriptionFromConfig() : Parameter
• GetParameterDisplayNameFromConfig() : Parameter
• GetParameterFromParameterGroupByName() : ParameterGroup
• GetParameterFromParameterSetByName() : ParameterSet
• GetParameterGroupAsJSON() : ParameterGroup
• GetParameterGroupFromParameterSetByGroupName() : ParameterSet
• GetParameterGroupVisibility() : ParameterGroup
• GetParameterKeyValue() : Parameter
• GetParameterLevelAsString() : Parameter
• GetParameterLevelFromConfig() : Parameter
• GetParameterLevelFromString() : Parameter
• GetParameterNodeFromParameterGroupByName() : ParameterGroup
• GetParameterNodeFromParameterSetByName() : ParameterSet
• GetParameterSetAsJSON() : ParameterSet
• GetParameterSetSelectionAsJSON() : ParameterSet
• GetParameterTypeForNamedParameter() : Service
• GetParameterValueAsString() : Parameter
• GetPluginConfigName() : Plugin
• GetPolymarkerServiceJobFromJSON() : PolymarkerServiceJob
• GetPreviousJobFilename() : BlastServiceJob
• GetProvidersStateTableAsJSON() : ProvidersStateTable
• GetQueryResultAsJSON() : QueryResults
• GetQueryResultAsResourcesJSON() : QueryResults
• GetQueryResultsPaths() : QueryResults
• GetReferenceServicesFromJSON() : ServicesArray
• GetRemainingSpaceInByteBuffer() : ByteBuffer
• GetRemoteParameterDetailsAsJSON() : RemoteParameterDetails
• GetRemoteServiceJobAsJSON() : RemoteServiceJob
• GetRemoteServiceJobFromJSON() : RemoteServiceJob
• GetRepeatableParameterGroupName() : ParameterGroup
• GetRepeatableParameterGroupRegularExpression() : ParameterGroup
• GetResults() : AsyncSystemBlastTool , AsyncSystemPolymarkerTool , BlastTool , ExternalBlastTool , PolymarkerTool , ThreadedBlastTool
• GetRunnableParameterAsJSON() : Parameter
• GetScaffoldsForDatabaseHit() : BlastServiceJob
• GetSchemaTermAsJSON() : SchemaTerm
• GetSchemaTermFromJSON() : SchemaTerm
• GetSchemaVersionAsJSON() : SchemaVersion
• GetSchemaVersionFromJSON() : SchemaVersion
• GetServersManager() : GrassrootsServer
• GetServiceAlias() : Service
• GetServiceAsJSON() : Service
• GetServiceByName() : Service
• GetServiceDescription() : Service
• GetServiceFromServiceJob() : ServiceJob
• GetServiceIcon() : Service
• GetServiceIndexingData() : Service
• GetServiceInformationPage() : Service
• GetServiceInformationURI() : Service
• GetServiceJobAsJSON() : ServiceJob
• GetServiceJobFromJobsManager() : JobsManager
• GetServiceJobFromServiceJobSet() : ServiceJobSet
• GetServiceJobFromServiceJobSetById() : ServiceJobSet
• GetServiceJobName() : ServiceJob
• GetServiceJobSetAsJSON() : ServiceJobSet
• GetServiceJobSetSize() : ServiceJobSet
• GetServiceJobStatus() : ServiceJob
• GetServiceJobStatusAsJSON() : ServiceJob
• GetServiceMetadataFromJSON() : ServiceMetadata
• GetServiceName() : Service
• GetServiceParameters() : Service
• GetServiceRefreshRequest() : Service
• GetServiceRunRequest() : Service
• GetServicesListAsJSON() : Service
• GetServiceUUIDAsString() : Service
• GetStatus() : AsyncSystemBlastTool , AsyncSystemPolymarkerTool , BlastTool , DrmaaBlastTool , PolymarkerTool , SystemBlastTool , ThreadedBlastTool
• GetStringLinkedListAsString() : StringListNode
• GetStringParameter() : AsyncSystemPolymarkerTool
• GetSymbolFromPlugin() : Plugin
• GetTempFile() : TempFile
• GetTempFilenameBuffer() : TempFile
• GetToolsSynchronicity() : BlastToolFactory , DrmaaBlastToolFactory , SystemBlastToolFactory
• GetToolType() : AsyncSystemPolymarkerTool , PolymarkerTool
• GetUIName() : Parameter
• GetURLEscapedString() : CurlTool
• GetUserAsJSON() : User
• GetUserByEmailAddress() : GrassrootsServer
• GetUserById() : GrassrootsServer
• GetUserByIdString() : GrassrootsServer
• GetUserFromJSON() : User
• GetUserFromNamedJSON() : User
• GetUserGroupAsJSON() : UserGroup
• GetUserGroupFromJSON() : UserGroup
• GetUUID() : BlastTool
• GetUUIDSList() : StringListNode