- r -

• ReadFromHandler() : Handler
• ReinitProvidersStateTable() : ProvidersStateTable
• ReleaseService() : Service
• ReleaseServiceParameters() : Service
• ReleaseSyncDataLock() : SyncData
• RemoveExternalServerFromServersManager() : ServersManager
• RemoveFromByteBuffer() : ByteBuffer
• RemoveFromHashTable() : HashTable
• RemoveMongoDocuments() : MongoTool
• RemoveMongoFields() : MongoTool
• RemoveParameterGroupChild() : ParameterGroup
• RemoveParameterKeyValuePair() : Parameter
• RemoveServiceJobByUUIDFromServiceJobSet() : ServiceJobSet
• RemoveServiceJobFromJobsManager() : JobsManager
• RemoveServiceJobFromServiceJobSet() : ServiceJobSet
• RemoveSQLiteRows() : SQLiteTool
• ReplaceCharsInByteBuffer() : ByteBuffer
• ReplaceParameterInParameterGroup() : ParameterGroup
• ReplaceParameterInParameterSet() : ParameterSet
• ReplaceServiceJobResults() : ServiceJob
• ResetByteBuffer() : ByteBuffer
• ResizeByteBuffer() : ByteBuffer
• Run() : AsyncSystemBlastTool , AsyncSystemPolymarkerTool , BlastTool , DrmaaBlastTool , PolymarkerTool , SystemBlastTool , ThreadedBlastTool
• RunAsyncTask() : AsyncTask
• RunAsyncTasksManagerTasks() : AsyncTasksManager
• RunBlast() : BlastTool
• RunCurlTool() : CurlTool
• RunDrmaaTool() : DrmaaTool
• RunEventConsumer() : EventConsumer
• RunEventConsumerFromAsyncTask() : AsyncTask
• RunPairedServices() : PairedService
• RunPolymarkerTool() : PolymarkerTool
• RunService() : Service
• RunServiceMatcher() : ServiceMatcher
• RunSystemAsyncTask() : SystemAsyncTask